Во время Великого Террора 1936-38 годов руководители партии и правительства санкционировали репрессии против жителей Азербайджана по спискам, которые были утверждены Политбюро ЦК. В российских архивах обнаружены 9 списков, в которых фигурировали жители Азербайджана. Всего на 383 «сталинских» списках были отмечены почти все руководители СССР, включая И. Сталина.